Luego de varios campeonatos este equipo a logrado entrar a copas importantes.

2007: Participación en la Copa Libertadores

Luego de ser campeón del Torneo Apertura 2006, Deportivo Pasto logró acceder a la Copa Libertadores 2007, siendo la primera participación en este certamen. Fue sorteado en el Grupo 8, junto al histórico Santos de (Brasil), el campeón uruguayo, Defensor Sporting y el argentino Gimnasia y Esgrima La Plata. Bajo en mado técnico de Álvaro de Jesús Gómez, no alcanzó ningún punto en el grupo y ocupó el penúltimo lugar en la tabla general del certamen, superando únicamente al club Alianza Lima de Perú.